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北京shotgun蛋白组学

更新时间:2025-09-08      点击次数:44

本文为了探究其潜在的分子机制,作者运用RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学,对不同成熟度水平的油脂种子进行了研究。不仅揭示了关键候选基因和蛋白质的时间特异性表达,而且为该树种的遗传改良提供了科学依据。中文标题:基于iTRAQ蛋白质组学和转录组学联合分析揭示油茶种子成熟过程中油质相关的关键代谢产物的积累研究对象:油茶种子发表期刊:HorticultureResearch影响因子:6.793发表时间:2021.07.01发表单位:海南大学园艺园林学院运用生物技术:RNA测序(RNA-seq)和iTRAQ标记定量蛋白组学、转录组学、蛋白组学文章中iTRAQ标记定量蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持蛋白验证新技术-PRM,平行反应监视蛋白组学。北京shotgun蛋白组学

随着质谱技术的飞速发展,特别是离子淌度的引入,增加了一个新的分离维度,将蛋白质组研究推进到全新的“4D蛋白质组”层面,打破了基于质谱的蛋白质组学研究的瓶颈,大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的***提升,可以更好的解决大队列、复杂体系以及微量样本的检测。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配备了***一代双TIMS分析器,离子容量可提高三倍。经过简化的离子透镜比较大限度地提高了离子传输效率和灵敏度,为4D-多组学建立了新的标准。CCS 值的加入让组学结果更精细,也使timsTOF Pro 2成为转化组学应用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能够实现少量细胞群或生物穿刺样本等低样本量的蛋白组定量分析以及磷酸化蛋白质组学分析,在短梯度下实现蛋白深度覆盖。北京shotgun蛋白组学一文了解DIA、TMT/iTRAQ、传统Label free蛋白组学区别在哪。

使用TMT标记定量蛋白质组学分析,与GFP-群体相比,在GFP+细胞中TM处理后,线粒体复合物IV的多个亚基被特异性下调,对下调的蛋白质进行基因本体 (GO)分析,显示参与线粒体电子传递链 (ETC) 的通路富集。同时作者还分析了从人 LM2 细胞系中分选的 LM2 GFP+和 GFP- 细胞,在 TM 处理 48 小时后蛋白组学分析,揭示了GFP+细胞优先富集,同时揭示了线粒体 ETC 相关的通路。因此,TM 处理特别影响具有更高细胞内铜水平的 SOX2/OCT4+ 细胞中的线粒体 ETC 通路。蛋白质组学分析确定了富含线粒体功能的途径。细胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一种线粒体金属酶,是线粒体ETC的终末酶。

通过蛋白质组学质谱鉴定、PRM靶向鉴定、iTRAQ标记定量蛋白组学等研究方法,发现了N-豆蔻酰化在肝脏**发生中发挥重要作用,揭示了NMT1的N-豆蔻酰化抑制抗**发生的NDP,并通过干扰泛素化来刺激促**发生的NUP机制。为靶向N-豆蔻酰化和NMT1可能有助于***肝*提供了理论依据。中文标题:NMT1依赖于POTEE发生N-豆蔻酰化并通过差异调节靶标的泛素化来刺激肝脏**的发生研究对象:细胞、小鼠、人**组织发表期刊:FrontiersinOncology影响因子:6.244发表时间:2021年5月合作单位:上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心运用生物技术:iTRAQ标记定量蛋白组学、PRM靶向验证、质谱鉴定、qRT-PCR、IHC、WB、IP文章中iTRAQ标记定量蛋白组学由欧易/鹿明生物提供技术支持定量蛋白质组学 蛋白质进行质谱检测未知蛋白进行全检测。

iTRAQ标记定量蛋白组学技术鉴定AHSG和RPL29分别是上调和下调*****的蛋白。301份肝*标本的统计分析表明AHSG与NMT1呈正相关,而RPL29与NMT1呈负相关(图8A)。此外,NMT1和AHSG均与**分期正相关,而RPL29与肝*的**分期呈负相关(图8B)。值得注意的是,NMT1和AHSG水平较高的肝*患者的生存率低于水平较低的肝*患者(图8C)。而较高水平的RPL29表明存活率较高(图8C)。这些数据表明NMT1、NUP和NDP与肝*的临床结果密切相关。iTRAQ蛋白质组学技术鉴定NMT1敲除时发生变化的蛋白质;修饰蛋白质组试-蛋白质组学 解决方案。北京shotgun蛋白组学

一站式服务,研究不同生物体在不同时刻/状态下蛋白质表达的变化。北京shotgun蛋白组学

并通过蛋白质组学和时间序列分析在血管生成中发挥着关键作用(图3E)。时间序列分析表明,外出刺激后ICAM1表达增加(图3F)。此外,当ICAM1在HBMECs中时,血管形成容量***降低(图3I/j)。这些结果表明M-Exos通过增加HBMECs中的ICAM1的表达来调节血管生成。蛋白质组学分析发现的差异表达蛋白与多种神经退行性疾病相关,包括帕金森病、阿尔茨海默病和亨廷顿病(图6B)。本研究运用蛋白质组学,蛋白质印迹,免疫荧光、免疫组化等分析了源自MSCs的外泌体可以使人脑微血管内皮细胞(HBMECs)保持活跃状态,有利于血管生成。应用PD小鼠模型发现MSCs的外泌体可以促进PD的恢复。结果可以为MSCs衍生的外泌体在PD***方面提供可能性。北京shotgun蛋白组学

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